תחקיר אירוע הפגיעה ב'אח"י חנית' שאירע יומיים לאחר תחילת המלחמה, ב-14 ביולי 2006, הוצג לרמטכ"ל דן חלוץ. על-סמך ממצאי התחקיר, קבע הרמטכ"ל כי האחריות הכוללת לאירוע הינה בראש ובראשונה של מפקדת חיל הים, המבצעית והמודיעינית ובראשה מפקד חיל הים. הרמטכ"ל גם החליט לנזוף במספר מפקדים בכירים בחיל הים ולנקוט בצעדים נגדם.

חלוץ הנחה על נקיטת שורה של צעדים פיקודיים נגד המפקדים בחיל הים, אשר נמצא כי להם אחריות על ליקויים שונים, אשר עלו במהלך בדיקת האירוע. ראש מספן המודיעין של חיל הים, קצין בדרגת אלוף משנה, ננזף פיקודית בפני הרמטכ"ל. מפקד שייטת ספינות הטילים, קצין בדרגת אלוף-משנה, ננזף פיקודית על-ידי מפקד חיל הים לאור הליקויים המקצועיים והמבצעיים שנחשפו בתחקיר. מפקד "אח"י חנית" ננזף אף הוא על-ידי מפקד חיל הים, בגין אחריותו לליקויים שנמצאו בספינה. כמו כן נקבע, כי תפקידו הבא של מפקד הספינה לא יהיה תפקיד פיקודי, אלא תפקיד מטה.

מפקד בסיס חיל הים בחיפה נזף פיקודית בקצין המכונה ובקצין האלקטרוניקה של 'אח"י חנית'. קצין האלקטרוניקה סיים את תפקידו ומשרת בתפקיד חוף.

מהתחקיר, אשר הוצג לפני כחודש וחצי לרמטכ"ל רא"ל דן חלוץ, עולה כי נמצאו ליקויים באופן שבו הבינו הכוחות את המציאות המבצעית. הדבר השפיע על טיב התפקוד המבצעי באירוע, שהיה, לפי התחקיר, לקוי. ביקורת נוספת היא על ההיבט המודיעיני: בכל הנוגע לתמונת המודיעין לפני האירוע, מצא התחקיר כי למודיעין לא היה מידע מדויק על אודות כלי הנשק שבידי החיזבאללה, אך למרות זאת היו חלקי מידע שהתקבלו בחיל הים בעבר, "שיכלו להוביל להנחה מבצעית שלפיה ייתכן שיש לאויב חימוש חוף ים". התחקיר ממשיך וקובע כי "ראוי היה לפעול מבצעית באופן שיקדם את פני האיום".

בתאריך 14.7.06 פגע טיל חיזבאללה מסוג C-802 מתוצרת אירנית באח"י חנית אשר היתה מוצבת כ-16 קילומטר מחופי ביירות. הטיל פגע בירכתי הספינה, גרם לנזק ולשריפה גדולה. מהפגיעה ומהאש שפרצה במקום נפגעו החיילים והם הוכרזו נעדרים. למחרת זוהו שאר גופות הנפגעים.