בבג"צ הושג (יום ג', 04.09.07) הסכם פשרה בין ועדת וינוגרד לבין העותרים נגדה, הסנגוריה הצבאית וח"כ לשעבר עו"ד אברהם פורז. העותרים דרשו כי לנפגעים פוטנציאליים מדוח ועדת וינוגרד תינתן הזכות להתגונן בטרם יפורסם הדוח הסופי.
בא כוח הוועדה עו"ד צבי אגמון התחייב כי הוועדה תשגר מכתב אזהרה לכל מי שבדוח או במסקנותיו יש מימצא פוגע לגביו. כמו כן הנפגעים הפוטנציאליים יורשו לעיין בחומרי ראיות נגדם וגם להגיב על הטענות. שאלת "הרחבת ההתגוננות", חקירת עדים באמצעות באי-כוחם של הנפגעים, תוכרע על-ידי הוועדה, על-פי "עוצמת הפגיעה". נשיאת בית המשפט העליון דורית ביניש הודיעה כי תכלול את התחייבות הוועדה, בהחלטת בג"צ בעתירות.
הסנגורית הצבאית ציינה בראיון לגלי צה"ל כי ההסכם יבטיח את זכותם של קציני הצבא, כולל זו של הרמטכ"ל לשעבר דן חלוץ, לדעת כי הם עומדים להפגע מהדוח, לדעת ממה הם ייפגעו וגם להתגונן.