השופט (בדימ.) יצחק זמיר מצטרף למזהירים מפני סכנתה של הממשלה למערכת המשפט. בראיון לרינו צרור בתוכנית "חוצה ישראל" שתשודר ביום רביעי 14.11.07, מתריע זמיר: "מערכת המשפט שלנו בסכנה יותר מאשר בעבר".
זמיר, שהיה בעבר שופט בית משפט העליון וכן היועץ המשפטי לממשלה, משגר כקודמו הנשיא (בדימ.) של בית המשפט העליון אהרן ברק, אזהרות על הסכנה הנשקפת לבית המשפט העליון עקב נסיונו של השלטון להגביר את כוחו ולשריין את עצמו מפני ביקורת. לדבריו כבר זמן רב מתנהל קמפיין "הסתה" נגד בית המשפט העליון, ומקורו אינו "בשוליים" אלא כזה "שהשלטון משתף עימו פעולה".
גם התקשורת משתתפת לדעתו במתקפה על בית המשפט העליון. ידיעות אחרונות למשל "לא מצא מילה אחת טובה לכתוב על בית המשפט העליון, והוא אף תולה את סחבת התיקים במערכת, בצמרת בית המשפט במקום במשרד ראש הממשלה והאוצר".
בראיון תוקף זמיר את ראש הממשלה אהוד אולמרט ש"ידע בדיוק את מי הוא ממנה לשר משפטים ומה התוכנית שלו בפועל", ומאשים את ראש הממשלה ואת שר המשפטים כי הם "פועלים נגד בית המשפט העליון למרות שהם אומרים דברים אחרים".
זמיר מודה שבהתנגשות ב"צמרת" בין שר המשפטים דניאל פרידמן לנשיאת בית המשפט העליון דורית ביניש קיים מצידה "אספקט אישי", אבל לטעמו מדובר ב"אספקט שולי". לעומת זאת פרידמן לטענתו "לקח על עצמו התחייבויות כתוצאה מההתערבות של הנשיאים (בדימ.) שמגר וברק, לחזק את מעמדה של נשיאת בית המשפט העליון ואת עצמאות מערכת המשפט. הוא התחייב ושום דבר מזה לא התקיים". זמיר מוסיף כי תפיסתו של פרידמן את הפרדת הרשויות "שגויה לגמרי. אין לה ידיים ואין לה רגליים".
זמיר מתנגד לפרישתו הקרובה של פרקליט המדינה שנדר. לדעתו שנדר צריך היה להשאר בתפקיד עד שיסיים את התיקים בעניינו של ראש הממשלה. "אני חושב שזה ראוי לאחר 7 שנים בתפקידי כיועץ המשפטי הודעתי על התפטרותי. יום לאחר מכן נודע לי על קו 300 והחלטתי להישאר בתפקיד. אמרתי יועץ משפטי חדש לא יוכל לטפל בזה".
