דיון נוסף במשפטו של מרואן ברגותי התקיים הבוקר (א', 4.5.03) בבית המשפט המחוזי בתל אביב. במהלך הדיון, הוצא ברגותי מאולם הדיונים מספר פעמים, לאחר שסירב לשתף פעולה עם בית המשפט.
ברגותי הניח ידיו על אזניו לשמע שאלות הפרקליטים, ובעת שתרגם המתורגמן את השאלות לערבית אמר לו: "אני אמצא אותך ואבוא אליך הביתה אם תדבר אלי".
במהלך הדיון אמר מרואן ברגותי לשופטים: "גנבתם לנו את המולדת הפלשתינית, והעובדה ששופטים אותי ללא סמכות רק מחמירה את המצב. אתם לא רוצים לשמוע את האמת על מה שקורה בשטחים... העם שעבר את הדבר הנורא של השואה, עבר סבל אדיר, הדבר הנורא ביותר בתולדות ההיסטוריה, ואתם רוצים לשלוט בעם אחר".
לדיון הגיעו גם מספר עדים הנחשבים פעילי טרור, בהם אחיינו ומי שנחשב יד ימינו של ברגותי, אחמד ברגותי. כמו כן נכחו באולם מספר חברי פרלמנט צרפתי.
בעת שעלה לדוכן העדים העד גמאל אל-חוול, ציין ברגותי באזני השופטים, כי כל משפחתו של אל-חוול נטבחה, לדבריו, בג'נין, והוסיף: "בית המשפט לא רוצה לשמוע מה קרה בג'נין".
ברגותי מואשם באחריות לרצח עשרות ישראלים ובפציעתם של מאות אחרים בפיגועים אשר יזם, תיכנן והוציא לפועל. הוא שב וטען, כי אינו מכיר בסמכות בית המשפט הישראלי וכי משפטו מסלים את המצב בשטחים.
