על סיפונה של ספינת מרמרה הייתה קבוצה שמנתה 40 בני אדם ללא תעודות מזהות זיהוי, ואפשר שמדובר בשכירי-חרב המסונפים לארגון הטרור אל-קאעידה. מידע בנושא נמסר (יום ג', 1.6.10) בישיבת קבינט הביטחוני שהתכנסה לדיון מיוחד.
המחבלים עטו לגופם שכפ"צים קרמיים, ונשאו אמצעים לראיית לילה וחבילה של כסף במזומן בכיסיהם. כמו-כן נמצאו ברשותם כלי נשק קר ואולי גם חם.
בעוד כל האזרחים המפגינים נשלחו לסיפון התחתון, הקבוצה התחלקה לחוליות נשארה על הסיפון העליון כדי לקדם את פני חיילי צה"ל. התרחיש הפסימי דיבר על תקיפת חיילים אך לא בסדר גודל שכזה.
ראש הממשלה
בנימין נתניהו אמר בישיבת הקבינט המדיני ביטחוני הערב: "זה לא היה משט שלום, אלא כוח אלים ומתוכנן. יש לנו סרטים וצילומים, שממחישים בפני מה עמדו הלוחמים שלנו, והדבר האחרון שאפשר לומר על הספינה הזאת זה שהיא משט שלום. ביקרתי היום את הלוחמים הפצועים בבית החולים תל השומר, ושמעתי מהם שחיכו להם על הספינה מחבלים חמושים בנשק קר: דיסקים חשמליים, גרזנים, סכינים, אלות, לומים וייתכן שהם חטפו גם אקדחים. הלוחמים שלנו פעלו מולם בקור רוח ובגבורה. אנחנו מצרים על כל אובדן חיים – אבל נותנים גיבוי מלא לחיילים, ללוחמים ולצה"ל על הפעולה הזאת".
נתניהו הסביר מדוע חייבים לבדוק ספינות שמובילות ציוד ואנשים לעזה: "אנחנו יודעים מהניסיון של מבצע '
עופרת יצוקה', וגם לפני כן, שהאמל"ח שנכנס לעזה מופנה נגד אזרחינו. יש בעזה מדינת טרור בחסות אירנית, ולכן אנו מנסים למנוע הכנסת אמל"ח לעזה באוויר, בים וביבשה. נכון שהם מבריחים אמל"ח דרך מנהרות, אבל הברחה דרך הים זה בסדר גודל כמותי לגמרי אחר. רק על האנייה 'פרנקופף' לבדה תפסנו כמאתיים טון אמל"ח שהוברח מאירן לחיזבאללה. פתיחת נתיב ימי לעזה תהווה סכנה עצומה לביטחון אזרחינו. לכן אנו מתמידים במדיניות הסגר הימי, ובודקים את הספינות. אין אפשרות לקיים את המדיניות הזאת בלי לבדוק את תכולת הספינות. נכון שיש לחץ בינלאומי וביקורת על המדיניות הזאת, אבל חייבים להבין שהיא חיונית כדי לשמור על ביטחון ישראל ועל זכותה של מדינת ישראל להגן על עצמה".
מזכיר הממשלה צביקה האוזר מסר בתום ישיבת הקבינט את הדברים הבאים: "הקבינט קובע שהטלת מגבלות על כניסת אוניות לעזה, הנשלטת על-ידי ארגון הטרור חמאס, היא פעולה מובהקת של הגנה עצמית מפני המשך התקפותיו של החמאס על אזרחים ויישובים בישראל, וכזאת הייתה פעולת צה"ל נגד הפרובוקציה האלימה בלב הים. הקבינט מצר על העובדה שהיו הרוגים באירוע זה אך מטיל את האחריות המלאה על הגורמים שנקטו בפעילות האלימה שסיכנה באופן מוחשי את חייהם של חיילי צה"ל".
הקבינט גם הביע את הערכתו המלאה לצה"ל ולמפקדיו שפעלו מתוך הגנה עצמית ושלח איחולי החלמה לחיילים הפצועים. "ישראל תמשיך להגן על אזרחיה מול בסיס הטרור של החמאס. ביטחון יישובנו ואזרחינו עומד מעל כל שיקול אחר", נאמר בהודעת הקבינט, שימשיך ויתכנס מחר, להמשך הדיון בנושא.