משרד הבריאות מבהיר כי אין כל חובה להקצות מקום למסגד מוסלמי בכל בתי החולים בישראל, מלבד שישה - מרכז רפואי רבין, שיבא בתל השומר, רמב"ם בחיפה, איכילוב בתל אביב, סורוקה בבאר שבע ובית החולים הדסה בירושלים. שישה אלה מוגדרים כ'מרכזי על' ועל-פי חוזר מנכ"ל משרד הבריאות קיימת חובה להקצות בהם מקום לתפילה.
בתשובה שניתנה לפניה שנעשתה במסגרת חוק
חופש המידע נמסר ממשרד הבריאות כי הקצאת מקום לתפילה מוסלמית בכל שאר בתי החולים הממשלתיים בישראל נתונה לשיקול הדעת של הנהלת כל בית חולים.
"בתי תפילה צריכים להיות מוקמים במרכזים הרפואיים הממשלתיים שיבא, רמב"ם ותל אביב, הנחשבים ל"מרכזי על". בשאר המרכזים הרפואיים אין הדבר מחויב ונתון לשיקול דעת המנהל", נכתב בתשובת משרד הבריאות. התשובה לא התייחסה למרכזים הרפואיים רבין, סורוקה והדסה שאינם בתי חולים ממשלתיים.
בתשובה נכתב עוד כי מבין בתי החולים הממשלתיים פוריה, בני ציון, שמואל הרופא, אסף הרופא וברזילי - רק בבית החולים פוריה קיים מסגד, וכי בשאר בתי החולים לא הוקצה עד היום מקום למסגד מטעמים שונים.
- בבית החולים ברזילי לא הוקצה מקום לתפילת מוסלמים מסיבה טכנית בלבד והיא הימצאותו של מקום מכובד לתפילה. "המרכז הרפואי פועל לאיתור מקום הולם במסגרת הבינוי בבית החולים".
- בבית החולים אסף הרופא (המרכז הרפואי שמיר) קבעה הנהלת בית החולים כי אין מקום להקמת בית תפילה למוסלמים ממספר טעמים ובהם מצוקת מקום ומיעוט מוסלמים המגיעים לבית החולים. "המרכז סובל ממצוקת שטחים משמעותית, ומשכך המקומות שכן מוקצים נועדו לשרת את היצע השירותים במרכז הרפואי. אחוז הפונים המוסלמים מסך הפונים לקבלת טיפול עומד על 7% בלבד", נכתב בתשובת משרד הבריאות.
עוד נכתב כי לעובדה זו יש משמעות משני היבטים: "פחות מעשירית מהפונים הם מוסלמים ומשכך אין הצדקה להקים בית תפילה נפרד; אחוז הפונים המוסלמים נמוך מחלקם באוכלוסייה באופן משמעותי, דבר אשר אף הוא מצדיק החלטה שלא לפתוח בעבורם בית תפילה מיוחד".
הנהלת אסף הרופא ציינה עוד כי המטרה של הקמת בית תפילה אינה "השוואת תנאים" ליהודים, אלא מתן מענה לכל המטופלים המוסלמים שבעבורם לפולחן הדתי יש חשיבות רבה. "אלו יכולים לבחור לפנות לאחד המרכזים הגדולים בארץ שבהם חובה לקיים בית תפילה", לשון התשובה.
- מהמרכז הרפואי שמואל הרופא נמסר שאין מקום לתפילת מוסלמים במרכז הרפואי וכי כרגע אין מקום מתאים להקמת בית תפילה מוסלמי ואין תקציב להקמתו.
- מהמרכז הרפואי בני ציון בחיפה נמסר כי לא הוקם בית תפילה למוסלמים במרכז הרפואי בשל מצוקה מבנית קשה, אשר מקשה עליו גם בהקצאת מקום לשירותים רפואיים שונים.