הרבנים הראשיים לישראל - הרב (הספרדי) שלמה עמאר, והרב (האשכנזי) יונה מצגר, מזהירים כי הם יפעלו לרישום "ספר יוחסין" - אם תמומש פסיקת בית המשפט העליון ויוכר "גיור קפיצה" לא רק לעניין זכויות, אלא גם לעניין ההלכה היהודית. כך אמרו הרבנים מצגר ועמאר, בראיון לאתר "חבדניק".

הרעיון העומד על הפרק, אם אכן יחליטו על כך הרבנים: רישום כל היהודים על-פי ההלכה בספר יוחסין - כך שכל גבר או אישה המבקשים להינשא יבדוקו את יהדותו של בן הזוג לפי ספר זה - ואז לא יהיה תוקף מעשי לפסק הדין, אלא לעניין זכויות.

הראיון נערך לאחר שניתן פסק הדין בבית המשפט העליון, שניתנה בהרכב של 11 שופטים. ההרכב ברוב של שיבעה שופטים (ובראשם הנשיא אהרן ברק) פסק, כי יש לאשר "גיור קפיצה" לעניין מתן זכויות ליהודים על-פי חוק השבות. השופטים הותירו פתוחה את שאלת הגיור לעניין ההלכה.

הרב עמאר נשאל בנושא, והשיב - על-דעת הרב מצגר, את הדברים הבאים:

"המגמה שלנו היא שלא לעשות ולהכין את הספר הזה. לעת-עתה הם מכירים בגיורים השקריים האלה, רק לעניין של זכויות, אבל אם יגיעו למצב שחס-וחלילה יכירו בזה להלכה, לא תישאר בידינו ברירה ולא יהיה מנוס מלהכין את ספר-יוחסין, שם נרשום את כל שמות היהודים שנישאו כהלכה. זהו דבר שנשמע קצת קשה, אבל בעידן המחשבים של היום, אפשרי הדבר. יהי רצון שה' ישים בליבנו אהבתו ויראתו ושרק חוק התורה יוכל לקבוע את אורחות חיינו מכאן ולהבא ולא שום גורם אחר".

פסק הדין שניתן מעורר ביקורת רבה מצד המפלגות הדתיות והרבנות הראשית. אלה טוענים כי פסק הדין יוצר מצב שבו תיגבר ההתבוללות ויירבו הגיורים הפיקטיביים. מנגד, המפלגות שינוי ומרצ מברכות על פסק הדין, המאפשר עתה לגישתם להתגייר בלא להיות לכוד "בידי" הממסד הדתי בישראל.