בג"צ דחה הבוקר (ג', 23.5.2006) את עתירת תושבי הכפר עיזרייה שטענו כי גדר ההפרדה פוגעת באפשרויות הפיתוח של הכפר ובמרקם חייהם. "נחה דעתנו כי מתכנני הגדר שקלו את כל השיקולים והחלטתם נמצאת במתחם המידתיות", קובע הנשיא ברק בדחותו את העתירה.
תושבי הכפר עתרו לבג"צ בטענה כי הגדר באיזור הכפר מוקמת "בחוסר סמכות ובניגוד לכללי המשפט הבינלאומי הפומבי" ופוגעת בהתפתחות העתידית של הכפר, ולכן איננו מידתי.
עוד טענו תושבי הכפר, כי תוואי הגדר המתוכנן מביא לכליאת הכפר ותושביו. לטענתם, המקרקעין שהופקעו מהם הם אדמות חקלאיות, המהוות מקור לפרנסה ולמחייה של משפחות הכפר. לדברי התושבים, הקפת הכפר בגדר תביא לניתוק תושבים מאדמותיהם ולפגיעה קשה בחיי המסחר, הכלכלה, החברה והפרנסה של תושבי הכפר.
המדינה ביקשה לדחות את העתירה, בין היתר משיקולי ביטחון. באי כוחה של המדינה, עו"ד אביטל סומפולינסקי ועו"ד אבי ליכט טענו, כי השליטה על הגבעות שהופקעו הכרחית על-מנת להבטיח הגנה מירבית לנוסעים בכבישים העוברים למרגלותיהן. גם המדינה הסכימה לטענה שאמנם נגרמת פגיעה מסוימת בתושבים הפלשתינים של הכפר עיזרייה, אך הפגיעה הינה מצומצמת.
לטענת המדינה, האדמות שנתפסו אינה קרקע חקלאית מעובדת, אלא אדמת טרשים, אשר ברובה מיוערת ואינה משמשת כלל לחקלאות או למקור פרנסה אחר של תושבי הכפר. באשר להתפתחות עתידית של הכפר, המשיבים טוענים כי תוכנית המתאר שהוגשה היא "תוכנית רעיונית גרידא חסרת כל תוקף משפטי".