פרקליט המדינה, ערן שנדר, אחראי לכך שמספר מאירועי אוקטובר 2000, במסגרתם נהרגו אזרחים ערבים על-ידי שוטרים, לא נחקרו סמוך להתרחשותם. כך לדברי ארגון זכויות האדם עדאלה.
בדוח מקיף שהוצג (יום א', 15.10.06) על-ידי הארגון תחת הכותרת "הנאשמים", הוא דורש כי תיפתח חקירה מיידית נגד מח"ש, בגלל מחדליה הקיצוניים מאז אוקטובר 2000 ועד להגשת הדוח מטעמה בחודש ספטמבר 2005. עוד דורש הארגון, להשעות לאלתר את כל האחראים למחדליה של מח"ש ובראשם ערן שנדר, מנהל מח"ש בשנת 2000.
הדוח, אשר יוגש ליועץ המשפטי לממשלה מני מזוז, מתייחס למחדליהן של רשויות אכיפת החוק ובראשן המחלקה לחקירת שוטרים (מח"ש) מאז אוקטובר 2000, בכל הנוגע לחקירת אירועי ההרג של 13 האזרחים באותו חודש.
הדוח דן בעיקר בשיטת העבודה של מח"ש. לפי הדוח, מח"ש הסתירה עובדות מהותיות מעיני הציבור ו"הציגה בדוח שהוציאה בחודש ספטמבר אשתקד מצג שווא, שלפיו היא חקרה את אירועי ההרג בחקירה מאומצת".
לפי הדוח, מח"ש כלל לא חקרה חמישה מקרי הרג, בניגוד להוראת ועדת אור כי תעשה כן; מח"ש הציגה מצג שווא בפני הציבור כאילו ביצעה חקירה מאומצת, אולם לאמיתו של דבר היא לא אספה דבר מטעמה. עוד נכתב, כי חקירותיה של מח"ש היו רשלניות ושטחיות. כך, למשל, חוקרי מח"ש לא העמידו שוטרים רבים על הסתירות שהתגלו בין הגרסות שמסרו למח"ש לבין דבריהם בפני ועדת אור; מח"ש הסתפקה באמירה כי השוטר סותר את דבריו, אך לא עימתה אותו עם אותן סתירות וסגרה את התיק.
עוד נמסר בדוח, כי "מח"ש לא הביאה בדל של ראיה חדשה על הראיות שהובאו בפני ועדת אור, ובכל זאת הגיעה למסקנות הפוכות מאלה של ועדת החקירה הממלכתית". עוד נמסר, כי מח"ש לא בדקה ולא עיינה בדוח משטרתי שהצדיק ירי צלפים גם בהעדר סכנה מיידית לחייהם של שוטרים וכי הסתירה את העובדה כי במקרה הרג אחד אבד הכדור שהוצא מגופתו של אדם שנהרג, לאחר שזה נמצא ברשותה קודם לכן.
ממשרד המשפטים נמסר בתגובה כי "למשרד המשפטים אמון מלא במקצועיות, בתום הלב ובהגינות של המחלקה לחקירות שוטרים וצוות פרקליטי וחוקרי המחלקה. כל ניסיונות הדה-לגיטימציה של מח"ש ואנשיה - נדחים על הסף". עוד נמסר כי "יש להבדיל בין דוח וועדת אור הנמצא כולו בתחום המנהלי לבין גזירת הליכים פליליים ממנו – הליך הדורש איתור ממוקד של כל מעורב, איסוף ראיות כלפיו והעמדתו לדין באופן שניתן יהיה להוכיח אשמתו מעבר לכל ספק סביר".
משרד המשפטים הוסיף כי "לפני כשנה החל צוות מיוחד במשרד המשפטים בבדיקת מסקנות מח"ש לגבי אירועי אוקטובר 2000.
הבדיקה מבוצעת על-ידי צוות פרקליטים בראשות המשנה לפרקליט המדינה, עו"ד שי ניצן, שהוא בעל הסמכות להחלטה בערר על החלטות מנהל מח"ש, ובשיתוף מחלקת עררים בפרקליטות המדינה. כל טענות ארגון עדאללה, שמרביתן הוגשו גם בעבר, תיבדקנה כעת כמקובל במסגרת הערר שמגיש הארגון".