השר אופיר פינס הודיע (יום ב', 30.10.06) כי הוא מתפטר מתפקידו. פינס מסר כי הוא העביר מכתב ליו"ר המפלגה, עמיר פרץ, ולמזכיר הממשלה, ישראל מיימון. עוד מסר פינס כי בכוונתו להתמודד על תפקיד יו"ר מפלגת העבודה.
השר פינס הודיע כי פעל בלב כבד. "החלטתי על ההתפטרות היא החלטה על-פי צו מצפוני. אני מאמין שאדם חייב לפעול על-פי צו מצפונו. נלחמתי ככל שיכולתי על-מנת שליברמן לא ייכנס, ולצערי רוב מרכז העבודה הצביע בעד הישארות העבודה בממשלה".
עוד מסר השר פינס: "הגשתי את מכתב ההתפטרות בלב כבד... יש צו אחד שאיני יכול להתכחש מפניו וזהו המצפון שלי, אחרי לא אהיה אני. אני מאמין באחריות קולקטיבית ובקבלת החלטות. אני מאמין בדין התנועה". פינס אני שלם עם החלטתי שלא להיות שותף בממשלה מי שמחזיקים באמונות ובדעות שסותרות את הערכים שלי באופן מוחלט".
עוד התייחס פינס לתפקוד הממשלה מאז המלחמה. "מאז מלחמת לבנון השנייה הממשלה איבדה את דרכה. האם התשובה למלחמת לבנון השנייה היא הכנסת ליברמן לממשלה? אם ליברמן הוא התשובה לאובדן הדרך לאחר המלחמה, הרי שהממשלה כולה צריכה להתפטר ולתת לימין להוביל את המדינה".
פינס, אשר רמז בעבר כי ייתכן ויתפטר מהממשלה בעקבות המהלך, אמר במהלך היום לאמצעי התקשורת השונים כי יפעל בכל כוחו כדי שלא לאפשר את ישיבת העבודה עם ישראל ביתנו בממשלה, ואם יקרה הדבר ישקול להתפטר. לפני הודעת התפטרותו, עסקו רוב חברי העבודה בניסיונות לשכנעו לחזור בו מהכוונה להתפטר.
יו"ר סיעת חד"ש, ח"כ מוחמד ברכה ברך את השר אופיר פינס על "יושרו ואומץ ליבו בהתפטרותו מהממשלה". "אנו מקווים שזו התחלת התגבשות אופוזיציה אמיתית", הוסיף. ח"כ ברכה מזהיר מפני "הציניות של מפלגת העבודה שתחתור למינוי שר ערבי בממשלת ליברמן המורחבת".
ח"כ אחמד טיבי (רע"מ-תע"ל) "מעריך מאד את אומץ ליבו של אופיר פינס". "כן ירבו כמותו למרות מיעוטם במערכת הפוליטית, יש צדיק בסדום בממשלה", אמר.