האתר ynet פיטר את הכתב הכלכלי הבכיר תני גולדשטיין בשל פעילותו לארגון העיתונאים באתר. כך קבע (22.4.12) בית הדין האיזורי לעבודה בתל אביב, אשר הורה להחזיר את גולדשטיין לעבודה.
גולדשטיין הודיע ב-19.1.12 על התפטרותו, אך חזר בו כעבור חמישה ימים ובית הדין קבע ש-ynet הסכים לחזרה זו. במקביל התארגנו כמה מחברי מערכת ynet לשם הצטרפות לארגון העיתונאים החדש שהוקם בחסות ההסתדרות; בראש ההתארגנות עמדו גולדשטיין, עורכת אתר הבית, אראלה גניסלב, ועורך ערוץ המחשבים, יהונתן זילבר. ב-3.2.12 נפגשו עשרה מעובדי ynet, ובהם שלושת המארגנים, עם אנשי ההסתדרות, וכעבור ימים אחדים החלו באיסוף צורפי הצטרפות לארגון.
בסוף ינואר קיבל ynet הודעה מאחד משותפיו הגדולים על הפסקת ההתקשרות, דבר שמשמעותו פגיעה מהותית בהכנסותיו. בעקבות זאת החליטה ההנהלה להעמיק את הקיצוצים שכבר בוצעו ולקצץ עוד 150,000 שקל בחודש, חציים במערכת וחציים במינהלה ובמיחשוב. בין היתר הוחלט שלא לאפשר לגולדשטיין לחזור בו מהתפטרותו ונשלחו זימונים לשימוע לפני פיטורים לעוד ארבעה עיתונאים, ובהם גניסלב, זילבר ובועז פיילר שהיה גם הוא ממובילי ההתארגנות. בסופו של נותר פיילר בעבודתו והשימוע של שני האחרים הושעה עם תחילת ההליך המשפטי.
השופטת
דגית ויסמן אומרת, כי אכן הרקע לקיצוצים המשבר בו שרוי ynet. ואולם, "לא שמענו הסבר מניח את הדעת כיצד מתוך החלטה על הפסקת עבודתם של שישה עיתונאים במערכת (ארבעה מועמדים לפיטורים ושניים שהתפטרו), ארבעה מביניהם הם חברי ועד הפעולה ולרובם תפקיד משמעותי בהתארגנות". לדבריה, מצב זה פוגע בזכות השוויון בעבודה ומהווה איתות ליתר העובדים לבל יצטרפו להתארגנות.
לעומת זאת, דחה בית הדין את טענות ההסתדרות לפיהן נעשו צעדים נוספים מצד הנהלת ynet בניסיון לפגוע בהתארגנות העובדים. היא אומרת, כי ייתכן שפנייתו של העורך הראשי, יון פדר, לאחד העיתונאים בניסיון להניא אותו מלהצטרף להתארגנות, הייתה בלתי ראויה - אך היא איננה מנוגדת לדין.