הרב הראשי לשעבר, הרב
יונה מצגר, הודה (יום ב', 30.1.17) בקבלת שוחד בסך 5 מיליון שקל לאורך עשר שנות כהונתו (2013-2003). ההודאה באה במסגרת הסדר טיעון שהוצג לשופט בית המשפט המחוזי בירושלים,
משה יועד הכהן. הצדדים יבקשו מהכהן לגזור על מצגר 3.5 שנות מאסר. הטיעונים לעונש יישמעו ב-8.2.17, וההגנה הודיעה שלא תזמן עדי אופי.
במסגרת ההסדר תוקן כתב האישום, כך שסכום השוחד בו הודה הרב מצגר הוא מחצית מזה שיוחס לו במקור. מצגר גם הסכים לחילוט של 2 מיליון שקל בדמות תפיסת דירת בנו בירושלים, לקנס של מיליון שקל ולתשלום 2 מיליון שקל לרשות המיסים. על-פי הודאתו של מצגר, הוא ביצע גם עבירות מרמה ומס, והעביר לנהגו
חיים אייזנשטט - העד המרכזי בפרשה - 2 מיליון שקל מהכספים שקיבל.
האישום הראשון עוסק ב"פרשת הגיורים", במסגרתו הודה מצגר, כי קיבל לכיסו טובות הנאה שמקורן בבעלי ממון תושבי חוץ אשר רצו להתגייר או לערוך בירורי יהדות, וביקשו את עצתו ועזרתו כרב הראשי לישראל. בשנים 2012-2007, בשלוש הזדמנויות, הפנה מצגר מתגיירים תושבי חוץ לרב
גבריאל כהן, ששימש כרב וכאב בית דין בלוס אנג'לס, תמורת מחצית מהכספים ששילמו הללו לרב כהן.
האישום השני עוסק בפרשת "אשכול העמותות", ובו הודה מצגר, כי פעל יחד עם אייזנשטט לגיוס תורמים לעמותות בתמורה ל"עמלה", תוך ניצול מעמדו ותפקידו כרב הראשי. מצגר סיכם עם מנהלי העמותות, כי בתמורה לפעולותיהם שלו ושל אייזנשטט, יתנו לו עשרות אחוזים מן התרומות שיתקבלו בעמותות בעקבות המלצתו ופועלו. עבירות אלו ביצע מצגר בעשרות מקרים ובקשר עם מספר עמותות, כאשר התורמים לא ידעו על "עמלות" אלו.
האישום השלישי עוסק בלקיחת שוחד בדרך של קבלת טובות הנאה שיטתית ע"י מצגר במהלך שנות כהונתו. טובות הנאה אלה קיבל מצגר במספר רב של הזדמנויות, בין היתר במסגרת אירועים פרטיים שלו, וכן כתמורה לכך שהשתתף באירועים שערכו נותני טובות ההנאה.
אישום נוסף עניינו קבלת דבר במרמה ממוסד תורני. על-פי כתב האישום, גייסו מצגר ואייזנטט תרומות למוסד תורני. מצגר נטל לכיסו 25,000 דולר מתוך התרומה שיועדה כולה למוסד התורני, מבלי שגילה לתורמים שעשה זאת. האישום החמישי הוא העלמת הכנסות בסך 3 מיליון שקל, והאישום השישי - לחצים של מצגר על אייזנשטט למסור גרסה כוזבת, שהופעלו כאשר מצגר ישב שבעה על אמו בשלהי 2013.
על-פי כתב האישום המקורי, הרב מצגר קיבל שוחד בסכום ריאלי של 10 מיליון שקל - הסכום הגבוה ביותר שיוחס אי-פעם לנאשם בודד. המדינה ייחסה לו גם גניבה בידי מורשה ו
הלבנת הון - עבירות שנמחקו מכתב האישום המתוקן. המדינה מיוצגת בידי עוה"ד
דני ויטמן ואילה יעקב-גלברד, ומצגר - בידי עוה"ד
טל גבאי ו
יהודה פריד.
