דוח המבקר משאיר אדמה חרוכה ברשות המיסים. על-פי הדוח, קיימים ליקויים בטיפול ביתרות זכות של נישומים. עקב ליקויים אלה נותרים בידי רשות המיסים בישראל סכומים גדולים שהיה עליה להחזיר, ולנישומים נגרמת פגיעה כלכלית.
המבקר מציין, כי בפברואר 2005 היו כ- 7,000 נישומים שמשרדי השומה עיכבו להם החזרים של יתרות זכות, שעל-פי פקודת המסים הם היו זכאים לקבלם. החזרים אלה הסתכמו בסכום אסטרונומי של כ- 800 מיליון שקלים.
מעכבים כספים - ללא סיבה נראית לעין
רשות המיסים בישראל עיכבה, על-פי חוק, מתן החזרים לנישומים שלא צירפו את כל המסמכים הדרושים לדוח השנתי שהגישו לה על הכנסתם, אך לא טרחה לפרט אילו מסמכים חסרים, ולא שלחה לנישומים דרישה להגיש את המסמכים החסרים.
מקרה נוסף שבו רשאי פקיד השומה לעכב החזרים לנישום הוא כאשר הנישום היה חייב להגיש הצהרת הון ולא עשה זאת. מהביקורת עולה, כי משרדי השומה עיכבו החזרים בנימוק שלא הומצאה הצהרת הון, גם לנישומים שכלל לא נדרשו להגיש הצהרה כזאת.
לינדנשטראוס מזכיר, כי גם אם קיימת מחלוקת בין פקיד שומה לנישום על גובה השומה, הוא רשאי לעכב רק עד מחצית מסכום החזר המס המגיע לנישום או עד הסכום השנוי במחלוקת, לפי הנמוך שבהם. אולם הרשות לא יישמה את הוראת החוק והיא מעכבת את כל סכום ההחזר.
המבקר חתם את הדוח בעניין רשות המיסים באומרו, כי "על הרשות לעקוב באופן שוטף אחר הטיפול של משרדי השומה בעניינם של נישומים שעוכב החזר היתרות שנצברו לזכותם בשל תשלום מס יתר, ולדאוג שיתרות שעוכבו ללא הצדקה יוחזרו בהקדם". לדעתו, "מן הראוי שרשות המס תשמור על זכויות הנישומים באותה המידה שהיא עומדת על כך שימלאו את חובותיהם" והוא מזכיר, כי השהיה לא מוצדקת של החזרי מס לנישומים פוגעת בזכויות הנישומים.