התנועה למען איכות השלטון בישראל מוחה כנגד ניהול הקרקעות במדינה על-ידי מינהל מקרקעי ישראל. בעתירה לבג"צ שהגישה התנועה ביום ראשון (26.11.06), באמצעות עורכי הדין אליעד שרגא, ברק כלב ודניאל קירס, מבקשת התנועה ממינהל מקרקעי ישראל להסביר מדוע אינו מפעיל את חובתו לאסוף נתונים על המקרקעין בישראל, עליהם הוא אחראי. לטענת התנועה, התנגדותו של מנהל מקרקעי ישראל לבצע סקר מקיף, תוך שהוא מעלים עין משימושים אסורים בקרקעות, גורמת למדינה נזקים בשיעור של מאות מיליוני שקלים.
מנהל מקרקעי ישראל אמון על 92 אחוזים מקרקעות המדינה, בהן הוא מוסמך לאכוף את הזכויות החוזיות של הציבור וההטבות המוענקות בקשר לנכסים אלו השייכים לציבור. ככל רשות מינהלית, חייב המינהל לשקול את הפעלת סמכותו, וזאת על-פי הדין המינהלי. במסגרת חובה זו, כל רשות מינהלית חייבת לאסוף נתונים, שאחרת שיקול דעתה יהיה לקוי.
העתירה מסתמכת על דוח מבקר המדינה, מיכה לינדנשטראוס, לשנת 2005 (דוח 56 ב'). בדוח זה מצויין כי המינהל לא קיים מעקב ובקרה על הנעשה בקרקעות שניתנו להם עדיפות לאומית. בכך, לדברי המבקר, מעניקה המדינה פטור ממכרזים למעסיקים, בכדי לעודד תעסוקה באיזור. היעדר הפיקוח, לדבריו, יוצר תמריץ לשימוש בקרקע המדינה שלא למטרה שלשמה הוקצתה.
מבדיקה שערך המבקר במספר מקומות נמצא, כי כשלושים אחוזים מהקרקעות אינן משמשות למטרה שלשמה הוקצו. העמותה מציינת בעתירתה גם את דוח המבקר הקודם, השופט (בדימ.) אליעזר גולדברג, שכבר עמד על כך שהמינהל אינו מנצל את מאגרי המידע שמנהלות רשויות אחרות בדוח 54 ב' (לשנת 2003). בדוח המדובר הזכיר המבקר תחום נוסף בו המינהל לא אוסף נתונים-תחום השכרת משנה של נחלות חקלאיות.
בעתירתה מבקשת התנועה, כי יוצא צו על תנאי נגד מנהל מקרקעי ישראל לנמק מדוע לא יבצע סקר נכסים על מקרקעי ישראל המוחכרים, וכן מדוע לא יאסוף את המידע על מקרקעי ישראל המוחכרים המצוי בידי רשויות מינהל אחרות. בנוסף דורשת התנועה כי מנהל מקרקעי ישראל ינמק מדוע לא ידרוש מאגף הפיקוח במינהל להגיש לו דוחות נתונים על הנעשה באזורי תעשיה, וכן מדוע לא יבצע תכנון של פיקוח שיטתי לצורך איסוף מידע על השימוש בקרקעות באזורי תעשיה. בנוסף דורשת התנועה לדעת מדוע לא יקים המינהל מערך שיסדיר את הפיקוח והבקרה על הנעשה בקרקע שהוקצתה על-ידו לתעשיה בפטור ממכרז.
לטענת התנועה, תפקידו של המינהל הוא "לנהל", וללא איסוף נתונים אין ניהול. על כן טוענת התנועה כי אי איסוף הנתונים של מנהל מקרקעי ישראל אינו סביר באופן קיצוני. עוד טוענת התנועה, כי נתונים על המצב בשטח יכולים לחסוך מאות מיליוני שקלים לקופת המדינה. לדברי התנועה, היעדר הסבירות מתגבר נוכח העובדה שאף ראש סיעת הליכוד בנימין נתניהו כבר התבטא בפומבי שהשחיתות החמורה בישראל עלולה לכאורה להימצא במצבורי נכסים מרוכזים וללא שקיפות.
