בית המשפט העליון דחה (יום ב', 30.3.09) בקשה של יגאל עמיר לבטל עונש שלילת שיחות הטלפון שהוטל עליו בעקבות ראיון "אסור" לערוץ 10. השופט אליקים רובינשטיין כתב בהחלטה כי הראיון של עמיר לערוץ 10 היווה עבירת משמעת ולכן העונש שהוטל עליו סביר. "בתי הסוהר חייבים להתנהל באורח שיש בו מסגרת ומשמעת שאחרת 'איש את רעהו חיים בלעו'", כתב.

בהחלטה נחשף עוד כי בשירות בתי הסוהר מתקיימת חקירה "משמעותית" בחשד כי שלילת הזכויות לעמיר נעשתה בהליך לא חוקי.

כאמור עתירת עמיר, באמצעות בא-כוחו עו"ד עדי קידר, לבטל את שלילת זכותו לשיחות טלפון נדחתה. עמיר טען כי הוא לא התראיין אלא קיים שיחת רקע שלא לפרסום ואף התרה בכתבת ערוץ 10 שלא לפרסמו. השופט דחה את הטענה וכתב כי ראיון לפי פקודת נציבות בתי הסוהר מתייחס לפרסום בעיתונות הכתובה, התקשורת האלקטרונית (רדיו, טלוויזיה), והאינטרנט, "באמצעות שיחה עם גורם תקשורת כלשהו". הוא הוסיף כי מאחר שאין דרך "מעשית הגיונית 'רגילה' לבקר מה היה תוכן שיחה פלונית עם כלי תקשורת והאם הייתה לשם פרסום או לא. לכן בכל שקוים מגע עם כלי תקשורת עניינו איפוא בראיון. ואין נחוצים לשם כך פלפולים והעברת פיל בקוף מחט" .

טענה נוספת של עמיר שנדחתה, כי הופלה בעונש לעומת אסירים ביטחונים אחרים, כמו ראש התנזים מרואן ברגותי, מאיר אברג'יל ופליקס חלפון, שביצעו הפרה דומה לזו שלו. השופט ציין כי ערך בדיקה וממנה עלה כי "על מרואן ברגותי ופליקס חלפון הוטלו עונשים שונים כגון שלילת ביקורים ובידוד. עונשים אלה אינם נופלים על פניהם בחומרתם מהעונש שהוטל על עמיר. באשר למקרה של האסיר מאיר אברג'ל אשר חטא כנטען בהפרה דומה לזו של עמיר והוא נענש באופן דומה". יש לזכור, כתב רובינשטיין, כי יגאל עמיר "מוגדר אסיר ביטחוני וככזה מוטלות עליו מגבלות כבדות יותר וכך הענישה על הפרתן".

כאמור השופט גילה כי מתקיימת בשירות בתי הסוהר "חקירה משמעותית" בחשד לפגמים בהליך שלילת ההטבות לעמיר. הוא הוסיף כי כאשר זו תסתיים "יוכל עמיר ככל שיהיה בכך צורך לשוב לפנות בעניין לערכאות המתאימות".

השופט ציין כי בפני עמיר נפתחה אפשרות נוספת, עם מעברו לבית סוהר חדש - שאטה. הוא יכול לדבריו לפנות למנהל בית הסוהר החדש ולבקש להשיב לו את ההטבות "מובן שיש בכך פתח לעמיר, והתוצאה נתונה לשיקול הרשויות, לאו מילתא זוטרא היא".