צה"ל הודיע בערב (יום ה', 25.9.03) על הטלת סגר כללי על שטחי יהודה, שומרון ורצועת עזה במהלך החג. מעבר לפלשתינים יותר רק במקרים הומניטריים בלבד, שיאושרו על-ידי מנגנוני התיאום והקישור.
משטרת מחוז ירושלים נערכת (יום ו') בכוננות שיא בהר הבית במלאת 3 שנים לעליית שרון. עליית מתפללים לתפילת יום השישי בהר הבית תוגבל - בעקבות הערכות על כוונות של צעירים פלשתינים להפר את הסדר במקום. תתאפשר כניסתם של מתפללים פלשתינים מעל גיל 40, המחזיקים תעודות כחולות. גיל הנשים לא יוגבל.
משטרת ישראל נערכת לקראת החג בכוננות מיוחדת
כוחות הביטחון נערכים בערב חג ראש השנה בכוננות מיוחדת. הכוננות כוללת פריסת אלפי שוטרים, שוטרי מג"ב, חיילים, מתנדבי המשמר האזרחי ועוד בריכוזי אוכלוסיה כבתי כנסת, ערים, שווקים, אתרים, פארקים ומקומות בילוי.
יוצבו מחסומים בסמוך לקו התפר וייערכו סריקות ובדיקות ביטחוניות במקומות בהם ריכוזי קהל כתחנות הסעה.
