מינהלת המעברים במשרד הביטחון החליטה על המשך פתיחת המעברים המשותפים בין ישראל לרשות הפלשתינית, והעברתם לידי מפעילים אזרחיים. על-פי ההחלטה, ביום ראשון (5.2.06) יועבר מסוף הסחורות בשער אפרים יעבור לידיים אזרחיות ויופעל על-ידי חברת מיקוד.
בדיון שהתקיים במשרד הביטחון ביום חמישי (2.2.06), הוחלט גם על פתיחתו מחדש ביום א' של מעבר קרני המשמש כמעבר סחורות לרצועה. המחסום נסגר לאחרונה בעקבות מידע מודיעיני כי יש כוונה לבצע פיגוע במקום. במהלך תקופה זו נערכה מערכת הביטחון להפעלה של מעבר כרם שלום, כמעבר חלופי, להכנסת מזון, ציוד הומניטרי ולהוצאת תוצרת חקלאית ותעשייתית. ההצעה נדחתה על-ידי הפלשתינים. במשרד הביטחון מציינים, כי התוצאה של הסירוב הפלשתיני גרם לפגיעה מתמשכת בכלכלה ובאוכלוסיה הפלשתינית.
המעברים קרני וכרם שלום הינם מעברים אזרחיים לכל דבר והם מופעלים על-ידי רשות שדות התעופה.
במשרד הביטחון אומרים, כי איזרוח מסוף הסחורות בשער אפרים מצטרף לשני מהלכי איזרוח קודמים שהתבצעו בינואר. ביום 16 בינואר אוזרח המעבר לתנועת פלשתינים בשער אפרים וביום 19 בינואר אוזרח מעבר ארז.
במעבר אפרים עוברות כיום כמאה משאיות ביום מתחומי יהודה ושומרון והכוונה להגיע למכסה של כ- 250 משאיות ביום. מעבר שער אפרים הינו מעבר הולכי הרגל העיקרי של אזור השומרון והוא משמש גם כמעבר סחורות.
תהליך איזרוח המעברים נועד לצמצם את החיכוך הקיים בין חיילים לאזרחים פלשתינים, וכן על-מנת לשפר את רמת השירות מבלי לפגוע ברמת הבידוק הביטחוני המתחייבת לצורך מניעת כניסתם של מפגעים לישראל. במהלך השבוע עצרו הבודקים בשער אפרים פלשתיני שניסה להעביר מטען דמה. במערכת הביטחון ציינו כי מדובר בניסיון לבחון את הערנות של הבודקים במקום.
במעברים אשר נמסרו לניהול גורמים אזרחיים הותקנו אמצעים טכנולוגיים מתקדמים, שיאפשרו בידוק אמין שיתבצע בפרק זמן קצר מכפי שהדבר נעשה קודם לכן, בתנאים סביבתיים משופרים שיאפשרו התייחסות טובה יותר לעוברים בו. בין היתר הותקנה במעבר ארז מערכת בידוק אישית הזהה למערכות שמותקנות באנגליה, הולנד, יפן וארה"ב.
