ההחלטה המתגבשת במשרד מבקר המדינה, בפרשת השוחד בעסקת כרמיה בירושלים, היא להמליץ בפני היועץ המשפטי לממשלה, מני מזוז, על פתיחת חקירה פלילית-משטרתית נגד ראש הממשלה, אהוד אולמרט, רעייתו עליזה, וכן נגד נותני השוחד - חברת אלומות, ובעליה איש העסקים גיל מסטיי. פרשה זו היא העיקרית בעסקי הנדל"ן המפוקפקים של אולמרט - הן מבחינת היקפה הכספי והן ברמת חומרתה, שהבשילה עתה לחקירה פלילית.
המלצה זו מתחייבת נוכח הממצאים החמורים
שנחשפו בתחקיר Nfc והוכחו בחקירת צוות החוקרים במשרד מבקר המדינה. בכירים במשרד ראש הממשלה, וכן פרקליטו של אולמרט, עו"ד אלי זהר, התבטאו ברוח זו באומרם, כי הם מבינים שהתיק יועבר לחקירת משטרה.
על-פי החשד, אולמרט ורעייתו קיבלו שוחד בהיקף של 320 אלף דולר לפחות. בתמורה הסדירו אולמרט ואנשיו, ובראשם מהנדס העיר ירושלים (באותה עת), אורי שטרית, מתן היתרים לחברת אלומות כדי שזו תוכל להקים את הפרויקט ואף לקבל זכויות בנייה עודפות. אולמרט ושטרית עשו שימוש מושחת ופלילי בפקידים בכירים בעיריית ירושלים, כדי להשיג את מבוקשם.
צוות החקירה במשרד מבקר המדינה, בראשו עומד נציב (בדימ.) יעקב בורובסקי,
חקר את אולמרט במשך כ- 45 דקות (יום ב', 25.09.06). בתום החקירה הוצאה הודעה משותפת. עם קבלת עדותו של אולמרט, סיים הצוות למעשה את שלב החקירה, במהלכה נחקרו כ- 25 עדים וחשודים. עתה יגובשו הממצאים, וככל הידוע - בכוונת המבקר לפרסם את ממצאיו לגבי פרשת כרמיה בתוך כמה שבועות.
במשרד מבקר המדינה ואצל היועץ המשפטי לממשלה מצוי מידע נוסף המעלה חשד חמור נגד אולמרט וכמה ממקורביו. היועמ"ש הודיע לעמותת אומ"ץ בתגובה לפניותיה אליו, על הנחייתו לפרקליטות לערוך בדיקה ראשונית בעסקי נדל"ן נוספים של אולמרט:
רכישת דירה מחברת אמריקה ישראל במחיר הנחה בפרויקט בתל אביב (מלצ'ט-שינקין) - פרשה זו נחשפה אף היא ב- Nfc; ומכירת בית
בשכונת נחלאות בירושלים במחיר מופרז לאיל הון אמריקני (פרשה זו נחשפה בערוץ 10).