אחרי גמר מותח, במהלכו הדיחו הצופים בבית בהצבעות אס-אם-אס את נטע-לי זלצרמן, החליטו חברי השבט הנותרים באמפי הרומי בקיסריה כי הזוכה הגדול בהישרדות 2: איי הפנינה הוא אריק אלפר, רופא בן 34 מבת ים. אלפר זכה בפרסים בשווי כמיליון ש"ח.
בתום עונה ארוכה באיי הפנינה, שהחלה ב-16 מועמדים ושני שבטים, הגיעו שלושת המועמדים האחרונים לגמר מותח בקיסריה מול כ-4,000 איש בקהל ומאות אלפי צופים בבית. מעל מאה אלף איש ניגשו לאודישנים להשתתפות בעונה השנייה של התוכנית, לאחר ההצלחה העצומה של העונה הראשונה, בה זכתה נעמה קסרי.
העונה השנייה עוררה דיון בעיתונות ובקרב הצופים בעקבות ליהוקה של נסרין, מתמודדת ערביה, והיחס אליה מצד נתן בשבקין, לוחם מג"ב שהשתתף בתוכנית ללא אישור מפקדיו. בשבקין אף עורר דיון במשרד השר לביטחון פנים, שכינס פגישה מיוחדת כדי לאשר לו להשתתף בתוכנית לפנים משורת הדין.
העונה השנייה לא זכתה להצלחה דומה לקודמתה, ובמהלך השנה סבלה מפגיעה ברייטינג, בין השאר בעקבות עליית "האח הגדול VIP" ו"המירוץ למיליון" בערוץ 2. מבקרים רבים טענו כי העונה השנייה מוצלחת פחות, בשל ליהוק מועמדים מעניינים פחות מבעונה הראשונה. אך ייתכן ואפקט הראשוניות של העונה הראשונה שיחק לטובתה.