בעקבות דוח מבקר המדינה שפורסם (ד', 22.2.06) בנוגע למינויים במד"א דורשת התנועה למען איכות השלטון להפסיק את כהונתם שליו"ר הוועד הפועל של מד"א, ד"ר נעם יפרח ומנכ"ל מד"א, אלי בין.
דוח הביקורת שפרסם מבקר המדינה השופט [בדימ.] מיכה לינדנשטראוס חשף שורה של מינויים, אי-סדרים ופעולה לא תקינה במד"א. בין יתר הדברים, מצא המבקר כי במשך שלוש שנים לא מונה נשיא למד"א, זאת בניגוד לחוק, וכי מינוי מנכ"ל מד"א, ומינוי יו"ר הוועד הפועל לקו בפגמים חמורים.
עוד מותח המבקר ביקורת קשה על שר הבריאות, דני נוה, בציינו כי "מעורבתה של לשכת שר הבריאות בעסקה שמטרתה סלילת הדרך לבחירתו של ד"ר נעם יפרח לתפקיד יו"ר הוועד הפועל של מד"א לאחר פרישת מר גור מתפקידו כיו"ר הוועד הפועל, משמעותה רמיסת הנורמות הציבוריות ברגל גסה".
בעקבות הדוח העבירה התנועה לאיכות השלטון לשר נוה וליועץ המשפטי לממשלה, מני מזוז, מכתב ובו דרישה להורות על העברתם של יפרח ובין מתפקידיהם במד"א.
"מקום בו עסקינן בגופים ציבוריים, ובפרט כאלו האמונים על שירות כה חיוני לציבור הרחב כמד"א, יש חשיבות עליונה בהתנהלות התואמת את הוראות החוק וכללי המנהל התקין, תוך מיצוי הדין עם מי שפעל לרמוס כללים אלה לצורך קידום ענייניו הפרטיים על חשבון טובת הציבור ככלל וטובת מד"א בפרט" כותבת התנועה במכתבה.
בתנועה מציינים כי כבר ב- 28 בנובמבר 2004 פנו לשר נוה והתריעו שבמינוי יו"ר הוועד הפועל לא ננקטו הליכי איתור נאותים.
בהקשר למינויו של יפרח כותבת התנועה: "כפועל יוצא ונוכח הפגמים האמורים אשר נפלו בהליך מינויו של ד"ר יפרח לתפקיד יו"ר הוועד הפועל, הרי כי יש לתת נפקות ממשית לממצאי דוח מבקר המדינה ולהפסיק את כהונתו של ד"ר יפרח כיו"ר הוועד הפועל, לאלתר, ובמקביל לקדם הליכי איתור נאותים למועמדים לתפקיד זה אשר מועמדותם תאושר על-ידי הוועדה לבדיקת מינויים".
לדבריהם: "מסקנה זו מתחזקת עוד יותר נוכח עיסוקו לכאורה המקביל של ד"ר יפרח במשרד הבריאות כרופא מתמחה בבריאות הציבור, וקביעת מנהל אגף משאבי אנוש במשרד הבריאות כי קיים ניגוד עניינים בין תפקיד זה לכהונתו כיו"ר הוועד הפועל".
בתנועה מציינים, כי גם את מינויו של בין לתפקיד מנכ"ל מד"א יש לבטל, זאת מכיוון שנבחר "באופן פגום ולקוי כל כך תוך עקיפת ההנחיות המחייבות, רמיסת המלצות מבקר המדינה, בניגוד עניינים מובהק ובפרט כאשר מועמד זה הינו חסר השכלה ובעל זיקה פוליטית אשר לא נבחנה על-ידי הוועדה לבדיקת מינויים".
עוד דורשת התנועה לפעול לאלתר למינוי של נשיא מד"א. "אנשים אשר מינויים נולד בחטא אינם זכאים להמשיך ולאחוז במינוי, ויש לפעול על-מנת לתקן את העיוות כדי להביא לכך שבראשם של מוסדות ציבוריים כאגודת מד"א יעמדו אנשים ראויים, אשר נבחרו בהליכים נאותים 'כטובים שבטובים" כותבת התנועה במכתבה.