במקביל ללחימה בגבול הצפוני של המדינה, נמשכת הלחימה גם ברצועת עזה. שתי רקטות קסאם נחתו בשעות הבוקר המוקדמות (א', 16.7.06) בעיר שדרות. לא היו נפגעים ולא נגרם נזק, זאת על אף שאחת הרקטות נחתה סמוך לבית ספר.
בצהריים, נחתו 5 רקטות קסאם נוספות. 4 רקטות נחתו באזור נתיבות ורקטה אחת נחתה בשדרות. לא דווח על נפגעים. גדודי עז אל-דין אל-קסאם, הזרוע הצבאית לתנועת החמאס הודיעה כי שיגרה שתי רקטות קסאם לעבר נתיבות. הרקטות נחתו בשטחים פתוחים בנגב המערבי ולא במרחבי העיר.
בהודעה שפורסמה על-ידי הגדודים נאמר, כי "הפעולה הזו באה מחלק של המערכה הנקראת "נאמנות החופשיים" אשר מתבצעת במטרה להדוף את ההתקפות הישראליות על רצועת עזה". כך פורסם בסוכנות הידיעות הפלשתינית "מען".
צה"ל תקף הבוקר, מהאוויר, תשתית מנהרה בדרום רצועת עזה, אשר יועדה להוצאת פיגועים לעורף ישראל. כמו כן, צה"ל תקף חוליות שונות של מחבלים.
במספר תקריות שונות נורו טילים נגד טנקים לעבר כוחות צה"ל. לא היו נפגעים בקרב חיילי צה"ל.
ג'בליה: שלושה חמושים נהרגו
כוחות שריון והנדסה של צה"ל נכנסו הלילה לבית חנון, ברצועת עזה. במהלך הלילה תקף חיל האוויר מבנה אשר שימש את החמאס בג'בליה שבצפון הרצועה, והפלשתינים מדווחים, כי שלושה בני אדם נהרגו בתקיפה. מצה"ל נמסר, כי הותקף מהאוויר מבנה בג'בליה ששימש את ארגון החמאס ואשר ממנו הוכוונה פעילות טרור שמטרתה פגיעה באזרחי ישראל.
במקביל, צה"ל עדיין שוהה בשדה התעופה בדרום הרצועה על-מנת למנוע העברתו של החייל השבוי גלעד שליט אל מחוץ לרצועה.
כמו כן, צה"ל תקף מבנה בשכונת נאסר בעיר עזה המשמש כמקום לפיתוח וייצור אמל"ח. במבנה עסקו פעילי ארגון החמאס בייצור ושדרוג רקטות קסאם המשוגרות לעבר מדינת ישראל. מהתקיפה נפגעו מספר פעילי הארגון ששהו במקום.
כמו כן, תקף צה"ל בצפון רצועת עזה, מהאוויר, את משרד הכלכלה של הממשלה הפלשתינית מטעם ארגון הטרור חמאס.