גורמים במשטרה אומרים, כי המידע שבידיהם צפוי להפליל את הרב הראשי לישראל, הרב
יונה מצגר, וכי מדובר בפרשה קלה לפענוח. ככל הידוע, תוך כדי החקירה עלו שמותיהם של מוסדות נוספים עבורם התרים הרב מצגר, כאשר לפי החשד חלק מהכסף הגיע לכיסו. ההערכות במגזר החרדי הן, שמנהלי מוסדות אלו ייעצרו גם הם וייאלצו להפליל את הרב מצגר.
אין כמעט ספק, כי מי שיודע את הפרטים מסר למשטרה מידע מדויק, משום שבחקירתו (יום ו', 21.6.13) נשאל הרב יונה מצגר על אותם כספים - היכן הפקיד או להיכן העביר אותם. הרב מצגר לא ענה בינתיים, אמר שהוא מבקש זמן, והבטיח שבחקירתו הבאה ימסור רשימה של כספים שקיבל ומה עשה עימם.
עוד מעריכים במגזר החרדי, כי אחד הנחקרים טען שהוא לא חלק ממארג האירועים, אלא היה רק השליח. אותו עד אמר, כי אינו מוכן לשבת בכלא בשל מעשים שאדם אחר עשה, ולפיכך מסר ממי לקח, מה העביר ולאן הלכו הכספים הללו. ככל הידוע, בידי המשטרה יש רשימות מפורטות שנתפסו במוסדות עבורם התרים, הכוללות את הסכומים שהועברו לרב מצגר ובאיזו דרך. כעת מנסה המשטרה לגלות מה עשה הרב מצגר בכספים אלו, האם הלבין אותם והיכן הם כעת. בין היתר נבדק האם הוא רכש נכסים שנרשמו על שמותיהם של קרובים ומקורבים.
חשד נוסף הנחקר כעת הוא, כי הרב מצגר קיבל טובות הנאה בתמורה להסמכה לרבנות ולמתן מסמכים ואישורים שונים במסגרת תפקידו. מקורות במשטרה אומרים, כי הם "הולכים על בטוח, הדברים ברורים ואין מקום לספקות". לאור זאת סבורים גורמים חרדיים, כי מצבו של הרב מצגר חמור עוד יותר מכפי שניתן היה להתרשם עד כה.